Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms