Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
LRP1Q07954 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms