Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME1Q06323 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms