Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CALD1Q05682 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CALD1Q05682 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms