Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A3Q01959 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms