Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
XPCQ01831 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
XPCQ01831 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XPCQ01831 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XPCQ01831 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms