Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDK6Q00534 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms