Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FAM3AP98173 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
FAM3AP98173 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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