Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PPP1CAP62136 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PPP1CAP62136 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms