Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVK-21P61565 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVK-21P61565 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms