Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIM2P55344 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIM2P55344 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIM2P55344 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIM2P55344 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIM2P55344 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIM2P55344 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIM2P55344 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIM2P55344 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIM2P55344 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIM2P55344 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIM2P55344 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIM2P55344 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIM2P55344 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms