Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP9P55211 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP9P55211 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP9P55211 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP9P55211 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms