Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PGGT1BP53609 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PGGT1BP53609 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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