Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
THOP1P52888 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
THOP1P52888 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
THOP1P52888 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
THOP1P52888 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
THOP1P52888 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
THOP1P52888 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms