Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EFNA3P52797 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNA3P52797 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms