Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPIAP49247 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPIAP49247 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPIAP49247 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPIAP49247 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPIAP49247 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPIAP49247 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPIAP49247 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPIAP49247 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPIAP49247 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPIAP49247 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RPIAP49247 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms