Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms