Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA9P31269 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms