Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PKLRP30613 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PKLRP30613 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PKLRP30613 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms