Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CMPK1P30085 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms