Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GTF2E2P29084 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms