Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
POLR2AP24928 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms