Protein–RNA interactions for Protein: P23975

SLC6A2, Sodium-dependent noradrenaline transporter, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A2P23975 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC6A2P23975 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms