Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CXCL3P19876 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms