Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCL3L1P16619 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCL3L1P16619 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms