Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDH1P12830 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDH1P12830 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDH1P12830 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms