Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SETSIPP0DME0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms