Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FAM58BPP0C7Q3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FAM58BPP0C7Q3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM58BPP0C7Q3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FAM58BPP0C7Q3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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FAM58BPP0C7Q3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM58BPP0C7Q3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM58BPP0C7Q3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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