Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEFLP07196 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEFLP07196 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NEFLP07196 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NEFLP07196 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NEFLP07196 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEFLP07196 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEFLP07196 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms