Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
DCTN3O75935 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms