Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PPFIA4O75335 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PPFIA4O75335 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms