Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRICKLE3O43900 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms