Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCO2O43819 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms