Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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PLXNB1O43157 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PLXNB1O43157 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PLXNB1O43157 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PLXNB1O43157 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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PLXNB1O43157 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PLXNB1O43157 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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PLXNB1O43157 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PLXNB1O43157 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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