Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCAO15360 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCAO15360 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCAO15360 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCAO15360 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FANCAO15360 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FANCAO15360 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms