Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC131649.1-201ENST00000569215 1313 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 HERC2P4-202ENST00000564145 683 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNPHO15079 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC105430.1-202ENST00000567477 483 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNPHO15079 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms