Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
J3QRK9 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
J3QRK9 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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J3QRK9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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J3QRK9 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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J3QRK9 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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J3QRK9 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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J3QRK9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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J3QRK9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
J3QRK9 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
J3QRK9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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