Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PATL2C9JE40 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PATL2C9JE40 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms