Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN25C9JDP6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms