Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XIRP2A4UGR9 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms