Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VWA8A3KMH1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms