Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PKP3Q9Y446 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PKP3Q9Y446 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms