Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC8Q9Y2L5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms