Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAK1Q9UPV9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms