Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF346Q9UL40 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ZNF346Q9UL40 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF346Q9UL40 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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