Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNA3Q9UI47 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms