Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5BQ9UGL1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms