Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX1-2Q9UD57 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKX1-2Q9UD57 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms