Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTSFQ9UBX1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CTSFQ9UBX1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms