Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DKK2Q9UBU2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DKK2Q9UBU2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms